鸡腿菇袋栽发菌栽培与畦式直播栽培比拟，具有发菌易反省、易控制发菌环境的温湿度、发菌成功率提初等优势，易于集约化消费。由于鸡腿菇菌丝抗逆性较强，不易老化，菌丝可长时间坚持生机，因此，只需具有条件，便可少量停止袋栽消费，并使其发好菌，待到适宜的时节再布置栽培出菇。发菌可按以下四个详细时期停止管理。
一、萌生期的管理此期3～5天，要坚持最佳生长温度，以求迅速恢复生长。菌种在掏出掰碎时，易受伤失水，若遇到高温（40℃以上）易被烧死，若遇高温则延迟生长。普通生料栽培温度可控制在20℃左右，经3～4天，接种点周围长出划一而稀疏的菌丝，即为萌生。此期管理以遮光、保温为主。生料栽培易出现毛霉，熟料则易出现桔白色链抱霉。所以拌料、操作进程及室内消毒很重要。
二、定植扩展期的管理定植扩展期也叫封面熟临时，约需10天。当菌种萌生后，迅速生长占领培育料面，成为与杂菌竞争的优胜者，此期菌丝生长旺盛，代谢作用增强，分解基质后二氧化碳增多，需氧量大，管理要点以散热、通风为主。接种5～7天要倒袋，床栽要揭膜，同时反省污染状况，及时处置。通风散热时间最好在无风空气沉静时停止，或在无风晴天停止，为预防杂菌侵入，培育料温度不高时可免此顺序。此期培育料温度普通比袋外高3℃～5℃，所以袋外表温度不可超越 25℃，以20℃左右为宜顺手摸有凉感为好，有热感则不好，烫手则发作烧菌现象。
三、平安生临时的管理平安生临时也叫菌丝延伸伸临时，菌丝长满培育料外表后，向培育料内继续延伸生长，直到培育料内全部长满菌丝。若温度较高，则菌丝生长速度快，菌丝细弱。为取得细弱菌丝，此期要通风、降温。接种5～20天，培育料少量散热阶段已过，鸡腿菇菌丝生长旺盛，需氧量多，通风很重要。培育好的菌丝外表洁白稀疏，划一往前伸长；稀疏细弱的菌丝，虽能出菇但产量不高。
四、菌丝成熟期的管理菌丝成熟期也叫菌丝回丝期，当鸡腿菇菌丝长满
全部培育料后，菌丝还要继续生长，表现为颜色进一步浓白。尤其是在平安生临时温度偏高、菌丝细弱时，更需求继续生长以使其尽快成熟。此期普通需4～5天，成熟期完毕后，菌丝中止生长并末尾扭结构成原基。此期是菌丝向子实体转化的关键时期，此期管理的重点：（一）添加光照，去掉遮阳物，用光抑制菌丝生长，促使菌丝扭结；（二）添加湿度，空气相对湿度为 85％以上；（三）降高温度，增大温差。以上三个条件如能及时满足，则能延长成熟期，否则会延伸成熟期和推延出菇。